lammps中fix_phonon计算有限温下MoS2的色散曲线

Kick

我最近想计算一下有限温下MoS2的色散曲线，总是计算不对。我参考了lammps中石墨烯的例子，感觉步骤上没有什么问题。希望大家能给我提点意见

我把我的结果还有建模以及计算过程全部放在附件里了，刚接触的同学也可以参考使用一下。

顺便我把附件里的README也贴出来吧，英文水平不高，让大家见笑了：
# Modify Time: 2018-12-11
You can know about the entire process by looking at the file: run.sh.

There is a matlab program in 'brillouin_zone' folder to show the first brillouin zone computed by me.

In the 'Wrong_plot' folder there is the result of my result.

I have showed you the whole process so that you can point out my problem.

Kick

我这里包括使用使用latgen建模，使用matlab画出MoS2的第一布里渊区，使用phana后处理等。

iSimuLy

哪方面感觉不对？

Kick

iSimuLy 发表于 2018-12-14 20:24
哪方面感觉不对？

老师，这个曲线跟论文里的不一样啊，所以感觉不太对，目前我可以确定增加体系可以减小断点的产生。

大卫007

您好，我也在算声子色散关系，我是window系统，想请教一下phana这个命令您是怎么安装的？需要下载什么东西吗？我在网上找了好久不也没找到什么资料

Kick

大卫007 发表于 2018-12-28 19:57
您好，我也在算声子色散关系，我是window系统，想请教一下phana这个命令您是怎么安装的？需要下载什么东西 ...

windows恐怕不行

njuedu

可能是系统原子数太少，模拟步数太少，需要测试

Kick

njuedu 发表于 2019-1-1 13:44
可能是系统原子数太少，模拟步数太少，需要测试

恩恩，确实这些也会有影响。
不过我已经找到原因了，参照phana里的参数-r 和 -s

chejunwei

您好，请教一下phana如何编译呢，我能看一下您的makefile文件吗，我的老是编译不成功

Kick

chejunwei 发表于 2019-4-7 23:11
您好，请教一下phana如何编译呢，我能看一下您的makefile文件吗，我的老是编译不成功 ...

我没有修改过Makefile文件啊，你出现了什么问题？