【LAMMPS】如何统计拉伸过程中化学键断裂情况

Zhou_GY · 发表于 2024-4-14 21:06:00

本帖最后由 Zhou_GY 于 2024-4-14 21:09 编辑

如何统计拉伸过程中化学键断裂情况
各位大佬！
有谁知道这篇文章（https://doi.org/10.1007/s11433-018-9316-3）中统计拉伸过程中化学键断裂方法的过程吗
以文中的Al--O键为例，论文中大概意思是先看Al--O的RDFs（径向分布函数如附图1）首个峰值后的最低点表示大于该分布距离的原子对概率为0，那么当原子对距离大于该距离可认为化学键断裂。
那么如何统计分子系统中Al--O的距离大于这个值的数量呢（如附图2）

iSimuLy · 发表于 2024-4-16 17:00:12

这个自己写个小程序就行了吧，读入轨迹，计算原子间距离，就能给出来。学会自己编成

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